虽然剧情和人物上与前两部并无直接联系,但故事题材依然围绕着缉毒警察与毒枭及其团伙的生死对决展开:毒枭康素差(刘青云 饰)一直带着手下张建行(郭富城 饰)从事毒品交易,新加入的成员欧志远(古天乐 饰)也因一次意外与两人有了过命交情,三人情同手足。康素差在香港的贩毒生意被警方查处后带团队逃到金三角发展,却意外发现身边藏有卧底。此刻,是敌是友,一片茫然......后来大反派派人来追杀,要取走火箭的大脑拿回去研究,火箭伤势惨重。星爵就带着他形态各异的队友们去到大反派老巢,目的是获得挽救火箭生命的关键装置-大脑密码,过程中顺带解救了其他试验动物和人类。